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作为帮助厘清“枢纽蛋白”
作用机制的关键,摘取细胞生物学研究领域上璀璨明珠的最大助力。
“影子网络”
的实证与细胞调控鲁棒性的系统生物学模型。”
这篇由计算团队主导的论文,可能是最具颠覆性的。
此前预测的“影子网络”
在此得到了部分实验验证。
团队利用cRISpRi高通量筛选技术,系统性地敲低了网络中被预测的关键节点,结果惊人地再现了计算模型的预测:当SFR-1被抑制时,数个“影子”
蛋白的表达上调,部分接管了其功能,维持了细胞基本的运输能力,尽管效率有所下降。
更重要的是,他们基于这些实证数据,在“方舟”
上构建了首个能够模拟细胞在基因扰动下维持核心功能(鲁棒性)的系统生物学动态模型。
该模型不仅成功预测了已知的备份通路,还指出了几个此前未知的、在极端压力下可能被激活的潜在补偿机制。
“细胞不是一个脆弱的线性机器,而是一个充满冗余和备份的韧性网络。”
赵栋梁在代表团队解释模型时强调:“理解并绘制出这张‘韧性图谱’,对于我们理解疾病耐受性、开发联合治疗策略具有至关重要的意义。”
......
当这些论文接连在《细胞》专刊上发表时,国际学术界从最初的震撼,逐渐转变为一种持续的期待与追随。
每一篇新论文的上线,都会立刻引发全球相关领域学者的集体解读与讨论。
而科尔德斯普林实验室的声音几乎已经完全沉寂,他们的那篇pNAS论文早已被淹没在这股由繁缕研究院掀起的洪流之中。
陆时羡没有满足于此,做事就要有始有终。
在这些系统性工作的基础上,他准备继续执笔该系列的阶段性总结论文。
题为《细胞智能调度网络:从原理到预测》。
他意在将所有发现整合成一个统一的理论框架,并展示了如何利用该框架,精准预测细胞在特定基因扰动或外界刺激下的适应性反应。
这一系列工作,将会彻底确立了“智能调度网络”
作为细胞生物学核心范式之一的地位。
因为它不仅提供了大量全新的、可验证的科学假说,更重要的是,它提供了一套全新的语言和工具,来理解和探索细胞的内部世界。
当《细胞》专刊上连续刊载的系列论文如同连珠炮般震撼全球学术界时。
陆时羡清楚意识到,仅仅通过论文传播已不足以完全展现这项工作的深度与广度。
是时候以一种更立体、更具冲击力的方式,向世界宣告一个全新科研中心的崛起。
他决定,以繁缕研究院的名义,在南江举办一场初步拟定名字为“细胞智能调度:从枢纽蛋白到生命设计新范式”
的全球专题学术报告会。
细胞智能调度学术报告会的消息甫一发布,便在全球生命科学界投下了一颗重磅炸弹,并引发了连锁反应。
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